定位基准/标准

STAM

小鼠大脑立体解剖图谱(STAM)是一份三维解剖图谱,它能够精确显示整个小鼠大脑的解剖结构,且具有单细胞级别的定位精度。

STAC

基于连续细胞构筑图像的食蟹猴矢状面参考脑图谱。

食蟹猴

食蟹猴脑MRI图谱

脑图谱

MiCAM

具有各向同性单细胞分辨率的小鼠全脑分子定义细胞图谱,提供 20 种细胞类型的全脑空间分布数据。

Resource

平台

配准平台

对不同模态的鼠脑图像数据进行自动配准,并提供了交互式配准修正的工具。

平台

文献检索平台

基于指针网络的预训练模型,可用于自动从文献中提取与神经科学相关的知识。

平台

CrowdTree

神经元在线重建平台,采用背靠背协作模式,支持多用户在线协同参与重建任务。

数据

HiNeuron

公开神经元3D图像数据集,按难度分级,用于重建算法研究。

数据

神经环路

将不同来源的神经元形态学数据配准到STAM上,支持空间定位、定量分析与全脑连接查询。

数据

STAM验证数据集

验证STAM划分脑区、核团的准确性,采用特定基因类型神经元分布、原位杂交(ISH)等多种标记和染色的辅助图像验证。

工具

任意角度切面可视化

沿着任意角度可视化脑图谱切面的服务。

工具

脑片自动配准服务

上传单张脑片,快速匹配对应图谱切面。

工具

图谱映射

支持CCF与STAM间三维数据双向映射与可视化。

工具

虚拟手术规划

虚拟手术导航与智能注射路径规划服务,可模拟小鼠脑注射操作。

工具

图谱切面

图谱重切面功能,可生成任意剖面,并作为STAM模块枢纽。